سم الثعابين هو إفرازات سائلة من الغدد اللعابية المعدلة من الثعابين السامة، وتعتمد الثعابين على السم لشل الفريسة ويساعد في عملية الهضم، والمكون الرئيسي لسم الثعابين هو البروتينات، وهذه البروتينات السامة هي سبب معظم الآثار الضارة لسم الثعابين، كما أنه يحتوي على إنزيمات والتي تساعد على تسريع التفاعلات الكيميائية التي تكسر الروابط الكيميائية بين الجزيئات الكبيرة، وتساعد هذه الإنزيمات في تدمير الكربوهيدرات والبروتينات والفوسفوليبيد والنيوكليوتيدات في الفرائس، وتعمل الإنزيمات السامة أيضا على خفض ضغط الدم وتدمير خلايا الدم الحمراء وتثبيط التحكم في العضلات.
عنصر إضافي من سم الأفعى هو توكسين الببتيد، والبوليبتيدات هي سلاسل من الأحماض الأمينية تتكون من 50 أو أقل من الأحماض الأمينية، وتفسد سموم الببتيد وظائف الخلايا التي تؤدي إلى موت الخلايا، وتوجد بعض المكونات السامة لسم الثعبان في جميع أنواع الثعابين السامة، بينما توجد مكونات أخرى فقط في أنواع محددة.