يعتبر تناول عين الجمل غذاء جيد للفرد وكذلك غذاء للبكتيريا النافعة الموجودة في الأمعاء، وبالتالي من فوائد عين الجمل أنه يحسن من صحة وكفاءة الأمعاء ويقلل من فرص الإصابة بالأمراض المعوية.
إن ما يتناوله الشخص ينعكس على صحته وعلى صحة البكتيريا المعوية النافعة، ومن الضروري الاعتناء بصحة تلك البكتيريا حيث أن عدم الاهتمام بها يؤدي إلى ارتفاع فرص الإصابة بالالتهاب ويزيد من إمكانية الإصابة بالسمنة.
في تجربة تناول فيها فيها ما يقارب المائتي شخص من البالغين حوالي 40 غرام من عين الجمل يومياً لمدة شهرين لوحظ زيادة كبيرة في أعداد البكتيريا النافعة في الأمعاء.