يعتبر الشمر أحد أكثر الأعشاب استخداماً في العلاجات الشعبية لمشاكل الجهاز الهضمي والبطن، حيث يساعد في علاج ما يلي:
انتفاخ البطن: يعتبر الشمرة مضاد تطبل البطن، لأنه يعمل على طرد الريح والغازات الزائدة من المعدة. ويساعد على تخفيف أعراض عسر الهضم أو انتفاخ البطن عند الرضع والأطفال.
الإسهال: بسبب خصائص الشمر المضادة للبكتيريا والالتهابات، فإنه يعتبر علاج فعال للإسهال الناتج عن الالتهاب البكتيري.
المغص: يمكن أن يساعد الشمر أو شاي الشمر على إرخاء العضلات، وبالتالي تخفيف أعراض المغص.
الإمساك: من فوائد الشمر المطحون أنه يعمل كملين للأمعاء، حيث يساعد على تنظيم الحركة التمعجية فيها، وبالتالي تحفيز الإخراج.