على الرغم من فوائد عصير البنجر العديدة إلا أنه قد يحدث لديك العديد من الآثار الجانبية بعد تناول البنجر وشربه، ومن أبرز هذه الآثار الآتي:
قد يتحول لون البول والبراز إلى الأحمر أو الوردي بعد تناول البنجر.
إذا كنت تعاني من انخفاض في ضغط الدم، فقد يؤدي تناول عصير الشمندر بانتظام إلى زيادة خطر انخفاض الضغط، لذلك قم بمراقبة ضغطك بعناية.
إذا كنت تعاني من حصوات الكلى (Kidney stones)، فلا تشرب عصير الشمندر، حيث أنه غني بالأوكسالات، وهي عبارة عن مواد طبيعية تتكون من بلورات في البول، قد تتحول إلى حصوات.