هناك مشاكل وراثية وصحية وتنظيمية وسلامة تجعل الحفاظ على السلالات أكثر صعوبة حيث تتكون الجينات بشكل أساسي من نوعين:
يجب على المرء أن يحاول تقليل مخاطر زواج الأقارب والانجراف الوراثي بمساعدة حجم السكان الفعال الكافي وأنظمة التزاوج المناسبة ونسب الجنس المتساوية قدر الإمكان.
لا يمكن تحقيق تقدم وراثي سريع في عدد قليل من السكان ، على الرغم من ذلك قد يحدث بعض الانتقاء الطبيعي غير المرغوب فيه ، ويمكن تطبيق بعض الاختيار من جانب واحد على مجموعات من 150 أنثى ، واستخدام تقنيات نقل الأجنة من شأنه أن يعطي إمكانيات إضافية ، ولكن هذا قد يتسبب في تكاليف.