يتغذى فأر الحصاد بشكل أساسي على البذور والفواكه والرحيق والمصابيح، ومع ذلك، فإن نسبة ضئيلة من نظامهم الغذائي يتكون من الحشرات خاصة في فصل الصيف، وكذلك الجذور والطحالب والفطريات ويتم تخزين بعض الأطعمة مؤقتًا تحت الأرض لفصل الشتاء وتشمل الأطعمة الأخرى القمح والشعير والشوفان والبراعم والذباب واليرقات.