تتزاوج سلاحف ماتا ماتا بشكل أحادي حيث تقترب الذكور من الإناث في البداية حتى توافق الأنثى على التزاوج من الذكر، وتستمر فترة الحمل ما من شهر أكتوبر إلى ديسمبر، وتتزاوج الأنثى مرة واحدة فقط في السنة، حيث تقوم بوضع ما يقارب من 12 إلى 28 بيضة في المرة الواحدة، يكون بيضها مستدير وهش يبلغ قطره ما بين 3 إلى 4 سم، تقوم سلحفاة ماتا ماتا باحتضان بيضها لمدة 200 يوم تقريباً قبل أن تتم عملية الفقس، ونفضل السلاحف التواجد في منطقة الأمازون أثناء وضع بيضها واحتضانه، فهي تحتوي على أماكن مفتوحة ومشمسة ورملية مناسبة لوضع البيض، فهي لا تفضل دفن بيضها في أماكن مغلقة و محفورة، بل تعمل على أنشاء عش له من النباتات التي تتواجد حول المستنقعات والغابات.