الإبحار نشاط شائع آخر على بحيرة مالاوي، وهو ضخم بما يكفي لتوليد بعض الأمواج الكبيرة والرياح السريعة المدهشة، وتحظى هذه الرياضة بشعبية كبيرة في الواقع، حيث يتم كل عام تنظيم ماراثون بحيرة مالاوي لليخوت، حيث يرسل البحارة في رحلة طولها 250 ميلًا تُسمى أطول سباق لليخوت في المياه العذبة في العالم، وماراثون اليخوت موجود منذ أكثر من 30 عامًا، وجذب فرقًا من مختلف أنحاء إفريقيا والقارات الأخرى، وعلى الرغم من أن المهارة والخبرة تلعبان دورًا مهمًا في السباق، إلا إن الماراثون غالبًا ما يوصف بأنه أكثر من حدث تحملي، حيث يختبر عزم المنافسين طوال الوقت.