إناث فرس النهر لديها فترة حمل تصل إلى ثمانية أشهر وتلد طفل واحد فقط في وقت واحد، وفقا لحديقة حيوان سان دييغو، وعند الولادة، يزن العجل ما بين 50 و 110 رطل (23 إلى 50 كجم)، وخلال الأشهر الثمانية الأولى من عمر الصغير يرضع العجل أثناء وجود فرس النهر الأم على الأرض، أو يسبح تحت الماء ليرضع، وعندما يغوص، يغلق العجل أنفه وأذنيه لمنع الماء، وجميع أفراس النهر لديها هذه القدرة، ويحتوي فرس النهر أيضا على أغشية تغطي عيونه وتحميه أثناء وجوده تحت الماء، وفي عمر 5 إلى 7 سنوات يكون عجل فرس النهر ناضجا بالكامل، وفقا لحديقة حيوان سان دييغو، ومتوسط العمر المتوقع لفرس النهر هو 36 عاما.