الثيوديا، أو مشكلة الشر، هي مجال آخر من مجالات النقاش المتعلقة بسيادة الله. والسؤال هو كيف يمكن التوفيق بين وجود الشر والمعاناة مع وجود إله سيادي وكلي القدرة والخير. وقد اقترحت مقاربات مختلفة، بما في ذلك وجهة نظر أوغسطينوس عن الشر باعتباره حرمانًا للخير والدفاع عن الإرادة الحرة، الذي يجادل بأن الله يسمح بالشر للسماح بحرية الإنسان الحقيقية. تسعى هذه المناقشات إلى دعم سيادة الله مع معالجة واقع الشر في العالم.