هناك بعض التهديدات كـ فقدان الموطن، والصيد الجائر، والمرض التي لا تستطيع الحمير الوحشية تجاوزها، ويبلغ عدد سكانها البرية حوالي 25000، ويصنف الحمار الوحشي الجبلي على أنها مهددة، واقترب حمار وحشي جبل الرأس من الانقراض نتيجة للصيد والتنافس مع الماشية الداجنة وفي عام 1937، تم إنشاء حديقة ماونتن زيبرا الوطنية في جنوب إفريقيا، حيث لم يبق منها سوى 47 حمارًا الوحشي الجبلي في كيب وزاد عددهم الآن إلى عدة مئات، ولا يزال معظمهم في الحديقة الوطنية.
وتم تدمير مجموعة حمار وحشي جريفي المهددة بالانقراض بسبب تفشي الجمرة الخبيثة، مما أدى إلى انخفاض صفوفها إلى ما يقدر بنحو 2250، وهناك تحالف ومنظمة مستقلة لحماية الحياة البرية في كينيا، ويعمل العلماء مع مجموعات حماية أخرى للمساعدة في الحفاظ على السكان واعتبارًا من أغسطس 2012، كان لدينا 128 ولادة حمار وحشي جريفي