يساعد تضمين فصوص الثوم النيئة يوميا في نظامك الغذائي في مشاكل في الجهاز الهضمي، حتى التهاب أو تهيج القناة المعدية يمكن تقليله باستخدام هذه العشبة، ويساعد الثوم على التخلص من معظم مشاكل الأمعاء مثل الإسهال والتهاب القولو،. ودورها في تبديد الديدان غير عادي، ولا يؤثر على البكتيريا النافعة في الأمعاء بل يقضي على البكتيريا الضارة، فهو لا يعزز الهضم فحسب بل يساعد أيضا في تخفيف غازات المعدة.