بعد فترة وجيزة من التكاثر، تبدأ التماسيح الإناث في البحث عن مواقع العش الملائمة، وعادة ما يحفرون حفراً ضحلة أو يصنعون أكواما من الغطاء النباتي، وفي بعض الأحيان تحدد موقع أعشاشها في أماكن مظللة، وتضع إناث التماسيح الكبيرة ما يصل إلى 90 بيضة في كل مرة على الرغم من أن الإناث الصغيرة لا تضع سوى عدد ضئيل منها، وبعد وضع البيض تعود إناث التماسيح إلى الماء، ولكنها تبقى قريبة لحماية البيض خلال فترة الحضانة بأكملها، والتي تدوم حوالي ثلاثة أشهر