يعتبر قرش الحوت من الكائنات التي تتغذى عن طريق الترشيح، فعندما يرغب في تناول غذائه يمدد الفكوك الكبيرة ويفلتر أو يصفي كل ما يصادفه من أجل هضم المخلوقات الصغيرة، ويعرف هذا باسم الترشيح عبر التدفق، ويتم استخدام هذه الطريقة في كل من قرش الحوت وقرش الباسكينج أو المتشمس الذي يعتبر ثاني أكبر اسماك القرش في العالم، وتشتمل هذه المخلوقات الصغيرة على العوالق والقشريات والأسماك الصغيرة التي تصبح محصورة في أسنان أسماك القرش بينما يحدث الترشيح، ويمكن لقرش الحوت تصفية أكثر من 1400 جالون من مياه المحيط في الساعة.