يعيش منقار البط فقط في المناطق المناسبة ذات المياه العذبة غير المضطربة، والتي يزداد الطلب عليها من أجل استخدامات أخرى حيث يتم تجفيف هذه المناطق وتلويثها للحصول على الأراضي. وتعد عمليات تطوير الجداول وضفاف الأنهار، والري، والسدود، والتلوث الكيميائي، وصيد الأسماك وحبسها من بين الأخطار التي يمكن أن تنفر منقار البط من مواطنه وتؤدي إلى تقليل أو انقراض المقيمين المحليين. وعلى الرغم من أن خلد الماء لا يزال منتشر في الكثير من نطاقه الحالي، إلا أنه يجب اعتباره معرض للخطر والتهديد