يمكن أن ينمو قنفذ البحر الأخضر إلى حوالي 3 بوصات عرضا و 1.5 بوصة ارتفاعا، والقنفذ مغطى بأشواك رفيعة وقصيرة، ويقع فم قنفذ البحر الأخضر (المسمى فانوس أرسطو) على جانبه السفلي وفتحة الشرج على جانبه العلوي في بقعة غير مغطاة بأشواك، وعلى الرغم من مظهره غير المتحرك، إلا أنه يمكن أن يتحرك قنفذ البحر الأخضر بسرعة نسبيا، مثل نجم البحر، بإستخدام أقدامه الرفيعة الأنبوبية المملوءة بالماء والممصات.