مفترسات وفريسة قنفذ البحر
على الرغم من مرونته الفطرية إلا أن قنفذ البحر معرض لتهديدات الأمراض والحيوانات المفترسة، وقضى مرض بكتيري عام 1981 تقريبا على بعض الأنواع في اليابان، ومرض قنفذ البحر الأصلع هو مرض بكتيري آخر يهدد بعض مجموعات قنافذ البحر مما يتسبب في تساقط أشواك الحيوانات وتركها بلا حماية ضد الحيوانات المفترسة، المحار مثل السرطانات والكركند من بين الحيوانات المفترسة الطبيعية لهذه الكائنات، وأسماك الزيناد وأسماك الراس البحري هما سمكتان يفترسها قنفذ البحر، وتم تجهيز ثعبان البحر الذئب خصيصا لاصطياد وتناول قنفذ البحر في نصف الكرة الشمالي.
وتساعد ثعالب البحر في مناطق مثل كولومبيا البريطانية في الحفاظ على التوازن البيئي عن طريق منع الإكتظاظ السكاني للقنافذ، وعلى الرغم من أنه يتحرك ببطء إلا أن قنفذ البحر لديه بعض الوسائل لحماية نفسه، وغالبا ما تكون أشواكه الحادة كافية لتثبيط بعض الحيوانات المفترسة، وبعض أنواع قنفذ البحر سامة أيضا، ويتغذى قنفذ البحر بشكل رئيسي على النباتات البحرية مثل الطحالب وعشب البحر، ويتغذى أيضا على الكائنات البحرية اللآطئة أو غير المتحركة مثل الإسفنج المرجاني والبحري.