مشاكل المياه هي واحدة من المشاكل الأكثر شيوعا لدى مالك حوض السمك عند محاولة الحفاظ على أسماك الزينة صحية داخل حوض السمك النظيف، فيجب أن يتحقق من مستويات الأس الهيدروجيني، ومستوى النترات، والنتريت، والقلوية، والصلابة، والأمونيا داخل حوض السمك على أساس منتظم، واستخدام شرائط اختبار حوض السمك في الماء لتحديد ما إذا كنت بحاجة إلى إجراء بعض التعديلات على المياه في حوض السمك، وإن إنخفاض أو زيادة مستوى القلوية أو الرقم الهيدروجيني أو الأمونيا في حوض السمك سوف يمنع السمك من الإصابة بالمرض بسبب سوء نوعية المياه .