فقدان الموائل هو أكبر ما يهدد الفقاريات داخل الحياة البرية:
السبب الأول لإنحدار الحياة البرية هو فقدان الموائل وتدهورها، والذي يمثل ما يقرب من نصف جميع التهديدات داخل كل مجموعة تصنيفية، بإستثناء الأسماك (28 في المائة)، ويشير التقرير إلى أن التهديدات الشائعة لموائل الحياة البرية تشمل الزراعة غير المستدامة، وقطع الأشجار، والنقل، والتنمية السكنية أو التجارية، وإنتاج الطاقة والتعدين، مضيفا أن تجزئة الأنهار والجداول واستخراج المياه هي أيضا أسباب سائدة في النظم الإيكولوجية للمياه العذبة.