أحد أكثر تطبيقات الهندسة الوراثية شيوعًا هو إنتاج محاصيل مقاومة للفيروسات ، يتم إنتاج هذه المحاصيل عن طريق هندسة مكونات الفيروسات في جينومات النبات ، لأسباب غير مفهومة جيدًا ، النباتات التي تنتج مكونات فيروسية بمفردها تقاوم العدوى اللاحقة بهذه الفيروسات ، ومع ذلك ، فإن مثل هذه النباتات تشكل مخاطر أخرى لتكوين فيروسات جديدة أو أسوأ