رأس السنة القبطية أمتداد لرأس السنة المصرية القديمة التى عرفها المصريون منذ أكثر من 7000 سنة، إذ جعلها العلاّمة الفلكى «توت» متفقة مع بدء فيضان النيل، ويُعتقد أن «توت» ينتمى إلى مدينة الأشمونين بصعيد مصر بالقرب من ملوي، وقد أطلق المصريون اسمه على الشهر الأول، وهو «شهر توت» وما زالت هذه الشهور القبطية أو المصرية القديمة هى التى يعتمد عليها الزارع فى وادى النيل فى مواعيد الزرع والحصاد.
لقد وضع العلاّمة «توت» نظام التوقيت على أساس اليوم الذى تظهر فيه الشمس مقارنة لنجم يبدو صغيراً وهو يوم «أقتران الشمس بنجم الشعرى اليمانية»، ويقول هيرودوت (484 – 406 ق.م.) – أب التاريخ – إن المصريين أول من وضعوا حساب السنة فقسموها إلى أثنى عشر شهراً حسب ما كان لهم من معرفة ونبوغ بعلوم الفلك وتحركات النجوم، فكانوا بذلك أصدق من الأغريق وأغزر علماً فى الأمور الفلكية.