قام ببنائه الملك العلوي مولاي إسماعيل عندما قام باسترجاع المدينة من الأسبان بالحملة الأولى واتخذه قصرا له، ثم قام الأسبان بحملة أُخرى ضد العرائش واتخذوا بناء الكوماندانسيا مقر للحكم العسكري، يوجد به ساعة كبيرة يقول المؤرخين أن الأسبان قاموا بأخذها معهم بعد انتهاء الحملة الثانية على المدينة، و يعتبر من أهم المزارات التاريخية في المدينة يوجد وراء البناء حي القصبة قرب المتحف الأثري ومسجد الأنوار.