يعيش قرش الحوت منتشرا في المياه الدافئة في المحيط الأطلسي والمحيط الهادئ والمحيط الهندي، ولأنه يوصف بأنه من أنواع أسماك السطح، فيسكن قرش الحوت مناطق بحرية مفتوحة على عكس أنواع أسماك القرش الأخرى التي تعيش بالقرب من قاع المحيط، كما يهاجر قرش الحوت عبر هذه المحيطات، وقد تم توثيق المسافة التي يعبرها خلال رحلته، وقد وصلت إلى حوالي 8000 ميل خلال ثلاث سنوات ونصف، وتعتبر المكسيك على وجه الخصوص المنطقة الشعبية لقرش الحوت في طريق الهجرة.