الأمراض الأكثر شيوعًا التي تصيب العقاب فيما يلي بعض الأمراض شيوعًا التي تصيب أشهر أنواع العقاب؛ العقاب الأصلع: داء المشعرات (Trichomonosis): ويسببه طفيل ترايكوموناس جالينا (T. gallinae)، إذ يتناول العقاب طعامًا ملوثًا بهذا الطفيل، وتبدأ الأعراض بالتهاب في الغشاء المخاطي، ثم تنمو تجمعات الطفيل، وتسد مجرى المريء، ويؤدي ذلك إلى تراجع مستوى التغذية والاختناق، ويُمكن علاجه عن طريق إعطاء العقاب دواء سبارتيكس، في حال اكتشاف الإصابة مبكرًا. فيروس غرب النيل (West Nile Virus): ينتقل هذا الفيروس من خلال البعوض، وتكون أعراضه التهاب الدماغ والفشل العصبي وتأثيرات سلبية على العينين والقلب، وفقدان الشهية وضعف الساقين. داء الرشاشيات (Aspergillosis): يُسبب هذا المرض كائنات فطرية، وذلك عن طريق استنشاقها من الجو من البيئات التي ينتشر فيها هذا الكائن، وتشمل أعراضه تكوّن أوراماً في الجيوب الأنفية، والقصبات الهوائية، والشعب الهوائية، والرئتين ويمكن أن يسبب نخرًا ونزيفًا في الرئتين. طفيليات الدم (Blood Parasites): وهي مجموعة واسعة من الأمراض تسببها طفيليات تهاجم خلايا الدم، وأكثرها شيوعً في الطيور الجارحة هي طفيليات (Haemoproteus spp) و(Leucocytozoon spp) ويمكن أن تنتقل من خلال القمل، والبراغيش القارضة، والذباب الأسود. الطفيليات الخارجية (Ectoparasites): مثل القراد والبق، وهي تتغذى على الدم، وتوجد في الأعشاش، وتُسبب تهيج الجلد والتهابه، ويمكن أن تقتل الفراخ التي لا تستطيع الطيران.