علاقة المدرسة بالكرسي المرقسي
اشتهر مديرو وأساتذة المدرسة اللاهوتية بالعلم والتقوى والغيرة الكبيرة علي خدمة كلمة الرب كما شهد لهم يوسابيوس (5:10)، فاختير منهم الكثيرون للكرسي المرقسي، وبخاصة أن الرهبة لم تكن قد ازدهرت، ولا حتى قد ظهرت في ذلك الزمان.
وأول مدير لهذه المدرسة اللاهوتية القديس العلامة يسطس، جلس علي كرسي مار مرقس، وصار السادس في عداد البطاركة. وعين القديس أومانيوس مديرًا للمدرسة ولما جلس أومانيوس (7) علي الكرسي المرقسي، عين مركيانوس لإدارة المدرسة، وصار مركيانوس الثامن في عداد البطاركة.
وكان البابا يوليانوس (11) من تلاميذ هذه المدرسة اللاهوتية. وفي عهد البابا ديمتريوس (12) تعين ياروكلاس مديرًا للمدرسة بعد أوريجانوس، وصار البابا الثالث عشر. وفي عهده عين القديس ديونسيوس للتدريس في المدرسة اللاهوتية، وصار هو أيضًا البابا الرابع عشر. وكان ياروكلاس وديونسيوس من تلاميذ أوريجانوس. وتخرج في هذه المدرسة أيضًا البابا بطرس (17) خاتم الشهداء، والبابا ارشيلاوس (18) والبابا اثناسيوس (20) والبابا تيموثاؤس (22).