أعمال البابا يوحنا الثالث:
سأل البابا يوحنا الرب أن يظهر له من يصلح أن يجلس من بعده على كرسى العظيم مار مرقس رسول المسيح , فعلم عن أخ فاضل متعبد فى دير القديس أنبا مقار بوادى هبيب إسمه إسحق , أخذه أسقف إسمه زكريا وصار يوحنا ولداً له وكان مملوء من نعمة المسيح التى كانت تعينه وتقويه وكانت له هيبة ووقار وإتضاع وكانت أعماله حسنة ورأى الناس إتضاعه وحسن أعماله فأرسل البابا يوحنا وأحضره إليه وصار يحافظ عليه مثل حدقه عينه ودربه على الكتابه والنسخ وتسجيل أعمال الكنيسة وإدارة الكنيسة
وقام هذا البابا بمساعده شعبه القبطى المحب للمسيح ببنيان كنيسه الشهيد الجليل مار مرقس الإنجيلى , وأتم بناؤها فى ثلاث سنين وزينها بمكان يليق ببيت إله , وإشترى لها أملاكا فى مصر ( يقصد الفسطاط ) وأخرى فى مريوط والأسكندرية للصرف عليها وعلى القائمين فيها .
يقول أبو المكارم المؤرخ (5): " كنيسة مار مرقس وهى التى كان يطلق عليها أسم القمجة (كلمة قمجة تعنى بالقبطية النزهة) وكانت خارج الثغر ومعنى كلمة القمجة هو النزهــة جدد بنائها السمنودى البطريرك الـ 40 وظل ثلاث سنين يرمم بنائها وأكملها ثم يكرز فيها الرتب وكرزت أولاً فى 6 أمشير وأشترى لها املاك فى مصر والإسكندرية وفى مريوط ، وأنشأ طاحون ومعصرة وآدر وساعدة المسيحيون القباط ببعض ما إحتاجه فى البناء الأخير . "