سبب التسمية للمسجد بهذا الاسم
قصة ايا صوفيا المتحف الذي عاد مسجدا تعود في أصلها لما يقرب من ألف وخمسمائة عام، وهي غير معلومة للكثير من الناس.
رجعت التسمية لمعمار آيا صوفيا نسبة إلى المرأة التي كانت قديسة وجنسيتها مصرية، وكانت ذائعة الصيت وكانت متعبدة بعد اعتناقها المسيحية، فتأثر بها الجميع ممن حولها، تأثرت القديسة بشهرتها بشكل سلبي حيث علم بخبرها الإمبراطور الوثني الحاكم إقلديانوس فعذبها وقام بقتلها.
أصبحت تلك المرأة هى الشهيدة في نظر كل إنسان مسيحي وضحية للفكر الوثني و دعت الحاجة لإطلاق اسمها على مبنى حول قبرها أصبح كنيسة، وهو مبنى ايا صوفيا.